手足口病絕大多數是很輕的，尤其是柯薩奇病毒A16型引起的手足口病，孩子一般只有輕-中度發燒，出少量皰疹，只需要在家隔離，經過對症治療和護理可獲痊癒。手足口病目前沒有特效藥物治療，主要是對症治療。家長要鼓勵孩子多飲水，多休息。用冷開水漱口，保持患兒口腔內清潔。進食應注意多給予涼稀飯、牛奶、豆花、蛋羹等。體溫較高的孩子可適當降低室溫，或採用溫水拭浴等物理降溫方法，體溫過高者可用少量退燒藥。
但近幾年來流行的腸道病毒71型手足口病常會引起一些重症病例，如：無菌性腦膜炎、腦炎、脊髓灰質炎樣綜合徵、心肌炎、肺水腫和肺出血等，可以導致病人死亡。另外，在手足口病流行季節，家長還要特別注意孩子發生無手足口病表現的腸道病毒感染。這些孩子常有手足口病或皰疹性咽峽炎接觸史，然後出現發熱、咽痛症狀，由於手足沒有皰疹，常常誤診為普通感冒或流感。但無手足口病表現的腸道病毒感染也可以導致腦炎、脊髓灰質炎樣綜合徵、心肌炎、肺出血等重症病例發生。
因此，家長要密切觀察孩子的病情變化。如果孩子出現不吃不喝，尿少色深、哭時沒有眼淚、口腔黏膜乾燥等脫水現象時，可以到醫院打點滴補液治療。如果發現孩子出現高熱不退、咳嗽、氣促、面色蒼白、精神萎靡、嗜睡不安、嚴重嘔吐、意識不清或抽搐等症狀，應該警惕孩子發生腦炎、肺水腫和心肌炎等嚴重病例的可能，應立即到醫院治療。