中草藥隨著科學技術的不斷發展和推進，人們認識和應用的增多，在 《中藥大辭典》中收載了5767種中草藥，面對如此繁多、來源廣泛的中草藥， 對於初學者來說，無疑是一件很難的事情。雖然品種繁雜、數量多，但是對 於大多數中草藥來說，命名都是有一定的來歷和意義的，藥名的確定往往和 藥物的性能、氣味、形狀、顏色、生長特性、入藥部位、生長環境、產地、 傳說故事等有關。以下是相關列舉。
1．因功能而命名
某些中草藥根據其功能的特點而命名：如防風能夠防治外感風邪；益母 草能夠治療婦產科方面的病症；大風子可以治療大麻風；淫羊藿可以治療陽 痿等病症；石決明、決明子能夠明目；續斷、接骨木能續筋接骨。
2．因氣味而命名
某些藥物有著特殊氣味，則按氣味特點進行命名：帶有「香」的中草藥 大都具有芳香氣味，如木香、藿香、丁香、茴香、乳香、沉香等；帶有「臭」 的中草藥大都臭氣難聞，如臭梧桐、臭牡丹、臭阿魏、臭椿等；帶有「甘」 的中草藥大都帶有甜味，如甘草、甘松；帶有「苦」的中草藥大都具有苦味， 如：苦參、苦楝子；帶有「辣」、「辛」的中草藥大都具有辣味，如：細辛、 辣椒；帶有「酸」的中草藥大都具有酸味，如酸棗仁；帶有「鹹」的中草藥 大都具有鹹味，如咸秋石；帶有「淡」的中草藥大都具有淡味，如淡竹葉、 淡竹茹；五味都具備者，如五味子。
3．因顏色而命名
許多中藥具有各種天然的顏色，因此，藥物的顏色也成了藥名的來源之 一。如紅色的有紅花、赤芍、丹參等；黃色的有黃柏、黃連、黃芩、大黃等； 青色的有青皮、青蒿、青黛、大青葉等；白色的有白術、白芷、白薇、白及 等；黑色的有黑豆、黑醜、黑芝麻等；紫色的有紫草、紫花地丁等。
4．以藥用部分命名
植物以花入藥的有菊花、洋金花、旋覆花等；以子人藥的有蓮子、萊菔子、菟絲子、枸杞子等；以葉入藥的有艾葉、蘇葉、淡竹葉、側柏葉等；以藤入藥的有海風藤、夜交藤、雞血藤等；以根入藥的有葛根、蘆根、山豆根等；以皮入藥的有秦皮、五加皮、地骨皮；以木質部分入藥的有蘇木、竹茄；以動物藥用部分入藥而命名的有蟬蛻、牛黃、鱉甲、龜板、鹿茸；礦石入藥的則有朱砂、赫石、滑石等。
5．因形態加以區分而進行命名
如牛膝，因其莖節粗而膨出，狀似牛的膝關節而得名；白頭翁則以其「近根處有白茸，狀似白頭老翁」而得名；狗脊的根上有金黃色的茸毛，酷似狗脊而得名，真是栩栩如生。其他如馬兜鈴、連翹、兩面針、八角蓮、木蝴蝶、七葉一枝花等也皆以形態而得名。
6．以生長特點命名
如半夏，農曆五月間成熟，恰巧是夏季過一半，故得其名；夏枯草因每到夏至便萎謝而得名；忍冬藤因經冬不凋而得名；萬年青因四季長青而得名；冬蟲夏草因其冬為蟲、夏為草，成蟲體與菌座相連而得名；冬青子因冬季採摘其成熟果實而得名。
7．因產地而命名
川藥、四大懷藥、浙八味、廣藥、雲藥、東北三寶等都是以產地命名的代表。
其他的還有：產於四川的蜀椒、川棟子、川芎、川貝母、川黃連；產于河南的四大懷藥（河南懷慶）如懷牛膝、懷山藥、懷菊花、懷地黃；產于浙江的白術、白芍、浙貝母、杭白菊、延胡索、玄參、筧麥冬、溫郁金；產於廣東的廣防己、廣藿香、廣金錢草；產于雲南的三七；產于東北的人參、鹿茸、貂皮；產于山東東阿縣的阿膠（用東阿縣阿井之水熬驢皮而製成）。
8．以十二生肖命名
例如，龍膽草、蛇床子、牛蒡子、馬兜鈴、羊蹄、豬苓、狗脊、猴棗、菟絲子、兔耳風、雞內金、雞冠花、雞血藤、鼠婦蟲、虎杖、虎耳草。
9．以傳說或人物故事命名
例如使君子。相傳潘州有一個姓郭名使君的醫生，善用該藥治療小兒疳積，因而出了名；何首烏，相傳古時有一姓何名田兒的老頭，身體虛弱，頭髮皆白，不曾有子，他在夜間看見一種藤本植物自行纏繞，自感好奇，挖根煮吃，久而久之，身體好轉，頭髮烏黑，壽長而百歲餘，故有何首烏之名；徐長卿，相傳古時有一個姓徐名長卿的人專以此藥治療邪病，而故名；杜仲，李時珍在《本草綱目》中謂：「杜仲，人名也。昔用杜仲服此得道，故此名之。」劉寄奴，此藥為宋武帝劉裕所發明，以他乳名寄奴命名。
10．以外來藥及譯音命名
國外或少數民族帶去輸入的藥材，常加「番」、「胡」，如番瀉葉、胡黃連、胡椒，更有譯名如訶黎勒、曼陀羅、阿芙蓉。
11．以貯藏期限命名
貯藏時間長者，如陳倉米、陳皮。
12．因炮製、加工方法不同命名
如糖參、紅參、生曬參、煨姜、炮薑。
13．因採集時間不同而命名
如菊花採集時間為九月，又被稱為“九月”。
14．因避諱而命名
在封建時代，為了避帝王的名諱，藥物也改換名稱。如延胡索，原名玄乎草，簡稱玄乎，後因避宋真宗諱，改名為延，稱延胡索、延胡，至清代避康熙（玄燁）諱，又改玄為元，故又稱元胡索、元胡。
15．以數字命名
例如，一點紅、一枝黃花、一支蒿、三七、三棱、四季青、四塊瓦、五味子、五穀蟲、五倍子、六月雪、七裡麻、七葉蓮、七葉一枝花、八角茴香、九節菖蒲、九香蟲、九裡明、十大功勞、百草霜、千金子、萬年青等。
來自 褚晨宇. 中藥治病，邊學邊用[M]. 2018